
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生态学 为其提供 TMT淀粉酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探讨成果
设计人士探求跟随着冰箱时长调长了牛羊肉的光洁度、持混流式水轮机、质地、自由铁含磷量、ROS、脂质过脱色物、MDA、GSH和GPX4技术水平来评定身体肌肉机构癌细胞膜的铁消亡心态。結果显示信息,冰箱时长调长了后,牛羊肉的光洁度在第3天和第6天相关性增涨;持水的能力大大减少;颜色等等变深,没有亮泽,鲜色转为暗色。前者,自由铁、几丁质酶氧和MDA的含磷量相关性增高,癌细胞膜凋亡率相关性提升。 钻研人工领取异同保鲜周期的腹肌原辅料的球核苷酸,如果实施SDS-PAGE了解,球核苷酸条带在异同时候分布范围不光滑且类似(图1a)。给出球淀粉酶在异同原辅料中的呈现情况发生,了解知道同样一组原辅料的中五位数亲近于同样一水准(图1b),说明怎么写腹肌原辅料球核苷酸兼具优良的组内类似性和组间异同性。 球营养素组学共判定出1996种球营养素。以B0为比较组,选择B1、B2、B4和B6中的球淀粉酶开展地域地域差异形容介绍,共判定到376个DEPs。将火山图交互式,并选择FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两位规范介绍DEP。但是下图1c-f如下,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别判定出22、33、73和140个DEPs,这其中分刘海别调整6、11、32和8八个,调低16、22、41和5俩个。聚类分析法技术考核了各种不同冷藏库时段.肌群进行中球营养素的形容,但是屏幕上显示肌群球淀粉酶形容地域地域差异近年来存储耗时的加强而加强(图1g)。
图1| 不一样的冷冻箱时的腿部肌肉印刷品血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有所不同保鲜时段的手臂肌肉打样定制距离血清定量分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死亡视频血清肽的PRM酶联免疫法阐述(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 立于KEGG丰度的差异表达出来血清的铁窒息死亡机理(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱微生物提供了TMT参考值核蛋白酶质含量组学技術工作,拜谱微生物已研发部门实现并成立了逐步完善成熟完善的转录组学、核蛋白酶组学、产生组学或两组学联动车辆技術工作组织体制,欢迎致电咨询!
参看期刊论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.