
2024年9月由南京市占农业的大部分院校张万刚硕士生导师拜谱生物在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物制品为该研究提供了亚硝基化修饰语组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
简体中文题目:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
刊物:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202多年的影响因素:5.7
刊发期限:2024年9月
用户企事业单位:南京农业大学
研发材质:蛋白
拜谱供应科技:亚硝基化修饰组学
技能自驾线路:
一、调查然而
01.Caspase-3亲水性
近年尚不清除NO对caspase-3的抑止反应有无归因于NO介导的S-亚硝基化,有差异 氧化还原电位梯度方向的GSNO作为一个外源性NO制造,以诱骗caspase-3的身体S-亚硝基化。后果证实,与无GSNO的组较之,100、200和400μM GSNO组的caspase-3生物差异性降底(图1),与已经新闻报导一致性。GSNO治疗降底caspase-3生物的隐藏的原因仍急待揭示。
图1 各种不同氧浓度的GSNO加工处理对caspase-3生物的影响到
02.Caspase-3的S-亚硝基化度
理论调查探讨Caspase-3的亚硝基化的度,以展现GSNO对Caspase-3的想法性。经GSNO清理后,检侧到caspase-3蛋白质S-亚硝基化比强度增高(图2)。这一些最终揭示,外源性GSNO的培养可好诱导型caspase-3的休外S-亚硝基化。真令人难以相信的是,在如果没有GSNO长期存在的对应组中检侧到1个变弱的S-亚硝基化带,这揭示caspase-3概率引发内源性的S-亚硝基化。除此之外,本理论调查探讨中caspase-3的S-亚硝基化的度较高,而caspase-3的可溶性大大减少,这与前几天的理论调查探讨统一。所以,caspase-3的特女性朋友S-亚硝基化遮盖位点尚不模糊不清,还需用深入骤的探求。
图2 GSNO正确处理对caspase-3S-亚硝基化情况的影响到
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化掩盖组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的回文队列。蓝色的标签的回文队列代表S-亚硝基化肽,红颜色标签的C代表S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3分解结淀粉酶
结淀粉酶质用于一个首要性的生殖受损细胞骨架淀粉酶质,在形成肌生殖受损细胞节构类型的节构类型详细其中,完好性和收宿性因素起特别要性的功效,探析S-亚硝基化caspase-3对结淀粉酶质吸附塑料的太敏理性都包括首要性现实意义。与Std(未用胱天淀粉酶质酶-3和GSNO孵育的刚开始肌食物玻纤淀粉酶质)组相较,0 μM GSNO组(肌原食物玻纤和caspase-3的孵育,无GSNO)的详细完好结淀粉酶质酸度特殊降底,建议caspase-3对结淀粉酶质都包括意向的淀粉酶质溶解效果。在GSNO孵育后,详细完好结淀粉酶质的酸度突出增多(P < 0.05)。显然,当GSNO酸度提升时,详细完好结淀粉酶质的酸度连续上涨(P < 0.05)(图5)。这一项看到阐明,SNO突显的caspase-3以的水平根据的方式方法抑制作用结淀粉酶质的吸附塑料。
图5.S-亚硝基化caspase-3降解塑料结球蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3可降解肌钙蛋白酶-T
肌钙球球球淀粉酶酶-T (TnT)是原肌球球球球淀粉酶酶调高承接肌回缩的细条的必需品肌原玻纤球球球淀粉酶酶。TnT的可分解症状是在线在线检测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化要求下,caspase-3对TnT的可分解情况发生就像文中6提示,与Std组(富含caspase-3和GSNO的肌原玻纤)比较,caspase-3组中30 kDa TnT精彩精彩片段强势上升,是因为caspase-3加入了TnT的可分解,因此,caspase-3与GSNO的孵育会造成30 kDa TnT减退。在100和200 μM GSNO组相互没在线在线检测到更为明显的的文化差异(P > 0.05),而当GSNO的密度提升400 μM 时,该精彩精彩片段强势极大减少(P < 0.05)。等等发现了是因为了SNO表达的caspase-3对TnT可分解的仰定制用。结球球球淀粉酶酶和TnT是caspase-3的皮肤敏感底物,而GSNO工作降底caspase-3的渗透性酶会会造成肌原玻纤球球球淀粉酶酶可分解的程度降底。由此可见所讲,NO引诱的S-亚硝基化可确认表达半胱氨酸残基来调高caspase-3的渗透性酶,因而进一次的影响力其对结球球球淀粉酶酶和TnT的球球球淀粉酶酶电离功能,为了的影响力牛肉片品格。
图6. S-亚硝基化caspase- 3降解塑料肌钙蛋清-T
二、个人总结
本研发重在探析S-亚硝基化对caspase-3淡化的后果以及其后来对牛羊肉肌原化学纤维板身体外分解的后果。核血清酶S-亚硝基化能够 淡化caspase-3的半胱氨酸残基,为了使得caspase-3亲水性有效降低,进十步调控了其对牛羊肉肌原化学纤维板核血清酶的核血清酶蛋白质水解学习能力。三、拜谱个人总结
探析方案按照了酶活核查,亚硝基化体现组学介绍,WB等检则的方式,发展淀粉酶S-亚硝基化可以体现caspase-3的半胱氨酸残基,这形成了caspase-3活性酶的大大减少,相结十步可抑制了其对牛肉片肌原氯纶淀粉酶的淀粉酶油脂水解特性。本探析方案为说明淀粉酶质亚硝基化对色泽的调节作用工作机制供应了了个新的第一视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的营养素酶质组学、掩盖营养素酶质组学、代谢率组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸品类车辆,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total空气氧化还原成、自由巯基,欢迎大家咨询!
借鉴论文文献:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663