在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

设计数据

1、从光敏教育培养细胞核中添加DNA交连蛋白酶质

是为了抽滤分离光化学热塑球核苷酸-DNA和好物于LC-MS介绍，小说家开发技术好几个种男变女纯化设计，可从DNA中去要不是化学热塑球核苷酸，仅在直射时采用马上什么是基因组交往含有DNA化学热塑球核苷酸。用TRIZOL添加固色质并洗去执行死刑获的非化学热塑球淀粉酶，然后呢将其再一次溶解性以根据RNase转化。采用高周波裁切获得的球核苷酸化学热塑DNA的添加物，在硫氰酸胍中烧开，然男变女，并在二被氧化硅抽滤柱上阵发性洗衣以去要不是化学热塑球核苷酸终会成功完成。采用核酸酶治理 从DNA中挥发释放光化学热塑球淀粉酶，并根据胰球淀粉酶酶转化于LC-MS介绍。该最简单的方法重新命名为球核苷酸化学热塑DNA添加或XDNAX。

图1.核苷酸质化学交联DNA提炼或XDNAX注意事项图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可会直接碰到DNA的淀粉酶质图谱

将光化学交联形式应用于MCF7神经血细胞，得知了1,805种待选核血清，另外1,191种普遍存在于3个或一些次重叠中。60%的DNA之间目的组含有核酸整合的GO注解，在贫乏核酸整合注解的核血清质中，很大的贡献度存在核纤层核血清，第二是体验复染质公司和神经血细胞分化的核血清质（图2）。

图2 . 可同时接处 DNA 的蛋清质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3个人小结了DNA互为用途组所蕴涵的血清质-DNA网页名词解释涵盖的核苷酸热塑肽。这包含会因为（1）球状DNA整合结构的域、（2）DNA 整合无章区（IDR）和（3）会因为与相关血清质（举例子组血清整合血清）、RNA（举例子剪接要素）或相隔离区室（举例子核仁血清）互为用途而会导致的大环境贴近。

图3 . 可立即接觸 DNA的结构类型域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、参考值生殖细胞扰动前三天与DNA联系的转录要素

女性刺肾上腺素药感觉α（ESR1）驻待在胞质溶胶中，终究会碰到其配体，引起易位到血細胞系，在去哪里它与DNA组中的单一空间搭配以启用单一的转录过程。将血清饥饿的MCF7血細胞系被暴露于高药量女性刺肾上腺素药（10 nM 17β-雌二醇）4分之五钟，与模拟仿真加工处理的对应血細胞系相对比较同旁内角的DNA互为能力组（图4A）。中间，女性刺肾上腺素药促使后DNA互为能力组中的ESR1加入了30倍（图4B）。总的看来，在1,814个定量分析的氨基酸质-DNA互为能力中，约有9%表示出超越2倍的特殊的变化，并查看到与ESR1更具互为能力的氨基酸如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌荷尔蒙加工乳房癌血细胞 DNA 相互间的作用组的酶联免疫法十分（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

个人总结

的设计探讨流入遗传遗传基因组的球营养物质以掌握它是怎么样被加载并付诸活动的，一只是的设计工人一暂时的最求。遗传遗传基因组可及性其主要以DNA为平台的角度来完成的设计探讨，可是，到现下就行，印染质凝露中的的球营养物质与DNA 造成电学双方功能尚不明了。适用零间隔光化学交联，可得知DNA双方功能组中的基本上都数球营养物质，XDNAX技艺将为球营养物质-DNA双方功能的设计探讨的变强软件工具。

拜谱总结ppt

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的淀粉酶质组学、表达组学、代谢转化组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

基准医学文献：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.