
近日,东莞医科二本大学1附屬医院专家王学浩科学院院士团队合作在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向疗法消耗的能量新陈代谢检测分析服务。
因为小标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕关键词:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
企业客户部门:南京医科大学
探索用料:细胞
拜谱展示 服务质量:转录组测序+淀粉酶互作组+靶向治疗能力代谢转化组
方法风格:
论述没想到
01、YBX1被检测为HCC中糖酵解的至关重要人类基因
本论述采集器HCC良性肺部肿癌模板(n=7)的单神经元RNA测序数据分析源集进行研究具体研究,找到糖酵解催化活性重点聚焦在良性肺部肿癌神经元中,hdWGCNA研究具体研究判断出9个基因组传感器(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的求生存游戏下载研究具体研究决定YBX1为独立性求生存游戏下载投资风险重要因素(图1H)。进一点结合起来IHC、WB实验设计和良性肺部肿癌企业与附近非良性肺部肿癌企业的余地转录组学数据分析源集否认YBX1是肝神经元癌的治疗的内在的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被判断为可以调节HCC细胞系糖酵解的关键的的因素
02、YBX1驱动HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗动能代谢率组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1推动HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1搭配并增强YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,球蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1根据并促进会YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提升其磷碱化,而带动其核转位
进一歩加测YBX1的O-GlcNAc糖基化是决定其磷过酸,在OGT敲低的HCC血细胞膜中或用OGT压溶液剂OSMI-1除理,YBX1核蛋清级别有效消减,YBX1磷过酸有效下降(图4A-C)。IP实验报告表现,在相当的Flag-YBX1底物级别下,YBX1-WT的磷过酸级别有效超过YBX1-T57A,认为磷过酸的增大不只仅是而且更好的YBX1核蛋清表示出来(图4D)。区分了核和质酚类化合物感觉TMG除理的HCC血细胞膜中YBX1核表示出来的增高(图4E-F),进一歩感觉YBX1磷过酸的核心调试细胞是AKT(图4G-I)。这感觉关注O-GlcNAc糖基化采用推进其磷过酸来利于YBX1核蛋清相对稳定义并推进核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 体现语极为有利的于其进两步遭受磷硝化作用体现语并要增强其核转位
05、YBX1带动PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1加速PKM2转录
06、YBX1 会上升组核蛋白乳过酸呈现水平方向
探讨发现了YBX1敲低可观拉低蛋白酶酶质乳酸性反应,尤其要是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解阻止剂2-DG的实验设计得知了糖酵解与组蛋白酶酶乳酸性反应的马上关联关系,阻止糖酵解可可观拉低H3K18la情况(图6D)。PKM2过传达可逆反应转YBX1敲低造成的H3K18la减少,以外源乳酸解决不禁提升自己H3K18la,还持续性YBX1传达上涨,提示卡具有正在向报告(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR得知,H3K18la采用丰度于YBX1打火子马上推进其转录,该工作受O-GlcNAc糖基化调整(图6H-J),高并发现了P300 上涨是YBX1怎强H3K18乳酰化做用的原则(图6K-L)。
图6.YBX1强化H3K18乳硝化作用遮盖平均水平
短文总结ppt
在一种研究探讨中通讯稿了YBX1在HCC中高展现,但是与糖酵解密码切一些。YBX1在T57处被O-GlcNAc绘制,可以稳固淀粉酶质并扩大其展现。各种绘制还带动YBX1在T57处的磷过酸,带动其核易位。为此,一种期间减弱了糖酵解一些表观遗传的转录并刺激到乳酸的带来。因此,YBX1激发P300的转录,必将驱动包组淀粉酶的乳过酸,尤其是H3K18la,H3K18乳过酸单向房产调控YBX1表观遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因正负极馈环考核机制图
拜谱工作小结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱微生物为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向疗法体力消化吸收组技术服务,拜谱生态学建立了完善成熟的转录组学、球蛋白组学、翻译工作后装饰组学、代谢转化组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
对比论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.