草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿模式化常用见的皮肤疾病之首。肾组织安排中CaOx结晶过饱和状态磨合会引起肾小管内部挤压伤和凋亡，可以引起肾结石的变成。短链油脂酸由肠管内生物滤池革兰氏阴性菌酵膳食结构棉纤维会产生，既在轮廓肠管深层中表现角色，还有在模式化标准上也表现关键所在角色。各举，丁酸是最大量的短链油脂酸，存在抗感染和抗体阻止角色,本科学研究讨论丁酸对CaOx肾结石的角色和意向靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山宠物医院泌尿整形外科吴忠老师、周子健医生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠客座教授、周子健硕士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物技术与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了微信网络药理学学服务项目，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

优秀文章品牌：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 雇主企事业单位：华山医院科室 研究探讨喜欢的人：大鼠、HK-2细胞核 分类产品信息：对比组（Con）、类别组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱展示 方法：电脑网络药学学检查测量

要点步骤程序流程图

探索然而

实验人员管理首要勾勒大鼠实体仿真型号，根据身体生化模式指数和组织结构病理学学染色的等实验的方式知道丁酸可避免CaOx实体仿真型号大鼠肾CaOx晶胞的养成和板材损害，优化CaOx实体仿真型号大鼠的支原体感染板材损害和阳极被氧化物品的过快表达爱。另外，丁酸还可控制草酸促进的HK-2细胞核核板材损害、阳极被氧化应激状态和细胞核核凋亡。 为洞察讲解一下丁酸组成类型和靶dna网，理论研究员工从PubChem添加丁酸和丁酸酯的二维和3D组成类型（图1A）。能够PharmMapper统计资料库和Uniprot统计资料库解决后共建立出117个丁酸靶dna供进一个步骤讲解。将dna信息库导成STRING统计资料库，展开PPI网讲解。Cytoscape总结出了排顺的前20的核心站靶dna的祥细网图，包涵CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这样的核心站dna与网中的其他的dna均成绩出千万的各种相关性具体分析，说明书这样的dna很有会充分利用着协同管理使用。GO和KEGG讲解具体分析了丁酸核心站dna的各种相关路径和菌物学模块（图1C）。核心站dna具体与类固醇缴素类回应、钝化应激性状态回应、灵活性酶氧肿瘤细胞对类固醇缴素类条件刺激的影响及对咸性生物制品学的物质的影响关于。上述情况表述，这样的核心站dna具体陆续参与了钝化应激性状态和对灵活性酶氧的菌物影响整个过程，是肾结石确立机理中重中之重性的路径，这表述丁酸很有会在肾结石中充分利用关键性性使用。

图1| 丁酸结构的与靶基因组互联网概述(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进这一步探究丁酸对CaOx肾结石真实切靶人类遗传染色体，研发工作有关员应用GEO数剧库对GSE73680中良好對照与CaOx肾结石女性的人类遗传染色体差异化使用了研发。對照组与CaOx结石女性的同质性性能差异化体现爱人类遗传染色体（DEGs）dna检测标准化为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个人类遗传染色体采取同质性波动，其中的3379个（89.4%）人类遗传染色体体现爱调涨，404个（10.6%）人类遗传染色体体现爱上涨（图2A）。对DEGs使用聚类分析法数据文件分析法数据文件分析，热图提示了前10个被选中DEGs的二维层次聚类分析法数据文件分析法功能（图2B）。最后，研发工作有关员能够 GeneCards数剧库劳动力鉴定会了370个能够与CaOx肾结石有关的人类遗传染色体，名列前20位的分折人类遗传染色体非常有关性评分标准如同2C表达。为了让获得丁酸诊疗CaOx肾结石的重点靶点，研发工作有关员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关人类遗传染色体净化处理获得好几回个Venn图。不可能，CYP2C9被决定为丁酸直接影响CaOx肾结石的自身靶点(图2D)。还有就是，研发工作有关员还使用了丁酸与CYP2C9的碳原子联接，CYP2C9的三种酪氨酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此用处，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在根据网站药剂学学估计CYP2C9是丁酸危害CaOx肾结石的靶表观遗传后，科研成员还能够 癌肿瘤细胞实验性验证了CYP2C9可影响草酸分析的HK-2癌肿瘤细胞的ROS平行、感染破损和凋亡。

图2| 部分据库综合了解預测CYP2C9是丁酸用处于CaOx肾结石的靶表观遗传

科学研究效果

本钻研第一个得知丁酸在休外和自身均能治理和改善CaOx肾结石仿真模型的空气阳极氧化应激状态性和发炎神经受损，马上又经由网药剂学学选择赢得丁酸影晌CaOx肾结石的隐藏的靶点——CYP2C9，后经由生殖血细胞检测可确认CYP2C9在草酸盐分析的HK-2生殖血细胞ROS品质、发炎神经受损和凋亡。一些得知是因为丁酸有可能经由治理和改善CYP2C9来治理和改善CaOx肾结石的空气阳极氧化应激状态性，降低发炎神经受损。某种时中拜谱生态学体加强了网药剂学学的新技术网络咨询管理，还有就是拜谱生态学体可加强熟落实的人类基因组学、血清质组学、分解组学等多个学成品及的新技术网络咨询管理，欢迎语拨打电话网络咨询！ 参考选取文献综述：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.